En 1948, Jacques-Yves Cousteau, sa femme et ses deux fils, vivent au paradis, dans une jolie maison surplombant la mer Méditerranée. Mais Cousteau ne rêve que d’aventure. Grâce à son invention, un scaphandre autonome qui permet de respirer sous l’eau, il a découvert un nouveau monde. Désormais, ce monde, il veut l’explorer. Et pour ça, il est prêt à tout sacrifier.
La jeune Kirra quitte l'Australie pour passer l'été en compagnie de son grand père en Afrique du Sud. Aussitôt arrivée, elle découvre un bébé épaulard échoué dans le lagon adjacent au parc d'attraction désuet de son grand-père. Elle nomme son nouvel ami ?Willy? et entreprend une grande aventure afin d'aider son ami orque à retrouver son groupe avant que l'avide rival de son gran-père ne parvienne à capturer Willy pour en faire un spectacle lucratif dans son nouveau parc
