Nicolas Shaw est un agent spécial américain à la retraite. Parallèlement, il fait partie d'une équipe d'élite "secrète" qui élimine les pires tueurs du monde. Après avoir été accusé de l'assassinat d'un membre de son équipe, Nicolas Shaw doit laver son nom et empêcher le meurtre des autres agents...
Après les incidents impliquant Heath Oslo, l'existence de l'organisation anti-terroriste américano-japonaise, connu sous le nom de CIRS, est maintenant connue du public. Le CIRS a été reconstruit à partir de zéro et ses fonctions les plus dissimulées ont été transférées dans une nouvelle agence : SORD (Social Ops, Research & Development). Le but principal de SORD est d'entraîner une nouvelle génération d'espions pour défendre le pays des menaces futures. Pour parvenir à
